Fastigheter kan förbli i Skärgårdsstiftelsens ägo och hyras ut om de har potential att bli ett behövligt nytt hem för någon som vill bo permanent i skärgården. Det här är kärnan i hela Skärgårdsstiftelsens verksamhet och det mest effektiva sättet att säkra fast bosättning också på mindre öar. (Läs mer t.ex. om Skärgårdsstiftelsens satsningar på Brännskärs skärgårdshemman i Nagu) Fastigheter som ärvs tillsammans med andra arvingar, eller som ligger utanför Åboland, säljs i regel på den fria marknaden. Om fastigheten är en året-om-bostad är Skärgårdsstiftelsens målsättning att den skall förbli i sådan användning, inte säljas vidare för enbart sommarbruk. Intäkterna går till att stöda Skärgårdsstiftelsens kärnverksamhet. Lösöre som testamenteras säljs via köp- och säljaffärer, eller doneras till annan välgörenhet. Möbler och föremål som har stark anknytning till en plats kan också få bli kvar i huset, om det förblir i Skärgårdsstiftelsens ägo.